38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1421 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1354  TrpR like protein, YerC/YecD  99.11 
 
 		 112 aa  225  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00831  putative TrpR-like protein YerC/YecD  67.29 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00135895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1203  hypothetical protein  63.29 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1209  hypothetical protein  63.29 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1755  TrpR like protein, YerC/YecD  72.86 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09650  TrpR-related protein YerC/YecD  56 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.077354  normal  0.07055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0713  TrpR like protein, YerC/YecD  48.61 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000346456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1455  TrpR like protein, YerC/YecD  45.57 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00161853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1060  TrpR like protein, YerC/YecD  42.31 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1764  TrpR like protein, YerC/YecD  43.59 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2379  TrpR like protein, YerC/YecD  36.45 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000677773  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1616  TrpR like protein, YerC/YecD  43.75 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0312  TrpR like protein, YerC/YecD  41.77 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000114687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2329  TrpR-like protein YerC/YecD  37.8 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0460  TrpR like protein, YerC/YecD  36.59 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2360  TrpR like protein, YerC/YecD  40.48 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1962  hypothetical protein  38.55 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1354  TrpR like protein, YerC/YecD  31.73 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1996  hypothetical protein  38.55 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1144  TrpR like protein, YerC/YecD  41.98 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1388  TrpR like protein, YerC/YecD  37.18 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2643  TrpR-like protein YerC/YecD  37.8 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1771  hypothetical protein  41.77 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000247541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0748  TrpR like protein, YerC/YecD  39.51 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1445  hypothetical protein  36.59 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0268  TrpR like protein, YerC/YecD  41.03 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000519773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02030  TrpR like protein, YerC/YecD  38.75 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0536  TrpR like protein, YerC/YecD  39.74 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01570  TrpR-related protein YerC/YecD  37.5 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144549  normal  0.996095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01780  TrpR-related protein YerC/YecD  37.36 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1488  TrpR like protein, YerC/YecD  39.29 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2038  Trp repressor  41.38 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0983  TrpR like protein, YerC/YecD  31.63 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0381  TrpR like protein, YerC/YecD  38.67 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0979  TrpR like protein, YerC/YecD  40.51 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000286042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0550  Trp repressor  27.59 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  34.62 
 
 		 76 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>