20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0550 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0550  Trp repressor  100 
 
 		 116 aa  237  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1616  TrpR like protein, YerC/YecD  33.78 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0935  Trp operon repressor  36.96 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0713  TrpR like protein, YerC/YecD  38.46 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000346456 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1354  TrpR like protein, YerC/YecD  34.33 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1421  hypothetical protein  34.33 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1203  hypothetical protein  27.16 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1209  hypothetical protein  27.16 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0924  Trp operon repressor  43.1 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0748  TrpR like protein, YerC/YecD  28.75 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  33.93 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1666  Trp operon repressor  28 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1755  TrpR like protein, YerC/YecD  31.67 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1060  TrpR like protein, YerC/YecD  32.91 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1455  TrpR like protein, YerC/YecD  27.08 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00161853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2038  Trp repressor  27.78 
 
 		 99 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09650  TrpR-related protein YerC/YecD  24.18 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.077354  normal  0.07055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0460  TrpR like protein, YerC/YecD  26.32 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1155  Trp operon repressor  30.36 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00831  putative TrpR-like protein YerC/YecD  29.17 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00135895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>