22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1155 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1155  Trp operon repressor  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1666  Trp operon repressor  67.78 
 
 		 91 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1922  Trp operon repressor  65.52 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  43.06 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004400  Trp operon repressor-like protein  37.93 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00999  Trp operon repressor  43.08 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0231  Trp operon repressor  38.96 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1755  TrpR like protein, YerC/YecD  38.57 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0935  Trp operon repressor  34.94 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0924  Trp operon repressor  31.58 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0659  Trp operon repressor  44.44 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3419  trp operon repressor  33.82 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0565  Trp operon repressor  40 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0554  Trp operon repressor  37.74 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1136  Trp operon repressor  32.35 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1206  Trp operon repressor  32.35 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000153675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1135  Trp operon repressor  32.35 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0676  Trp operon repressor  39.62 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107752  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3482  Trp operon repressor  42.55 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0815  Trp operon repressor  42.55 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3612  Trp operon repressor  42.55 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0550  Trp repressor  30.36 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>