32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0924 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0924  Trp operon repressor  100 
 
 		 92 aa  183  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004400  Trp operon repressor-like protein  46.55 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1666  Trp operon repressor  34.25 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0554  Trp operon repressor  33.33 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0231  Trp operon repressor  32.39 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0621  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1566  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1155  Trp operon repressor  31.58 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0550  Trp repressor  43.1 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00999  Trp operon repressor  31.94 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4993  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.873782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4941  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4834  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4907  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4995  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0676  Trp operon repressor  30.12 
 
 		 109 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107752  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1922  Trp operon repressor  28.4 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0565  Trp operon repressor  35.82 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  32.86 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0659  Trp operon repressor  28.38 
 
 		 108 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5908  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.993559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04234  hypothetical protein  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3663  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4941  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4945  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04269  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4992  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4629  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3604  Trp operon repressor  36.84 
 
 		 98 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1301  Trp operon repressor  34.38 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000284833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2909  Trp operon repressor  32.1 
 
 		 92 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3676  Trp operon repressor  37.7 
 
 		 115 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>