40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1666 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1666  Trp operon repressor  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1922  Trp operon repressor  85.56 
 
 		 91 aa  154  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1155  Trp operon repressor  67.78 
 
 		 103 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  43.66 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0924  Trp operon repressor  34.25 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00999  Trp operon repressor  34.57 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004400  Trp operon repressor-like protein  34.57 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0565  Trp operon repressor  41.38 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0231  Trp operon repressor  41.82 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0676  Trp operon repressor  41.51 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107752  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0935  Trp operon repressor  38.67 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0554  Trp operon repressor  39.62 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0659  Trp operon repressor  40 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3482  Trp operon repressor  42.55 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0815  Trp operon repressor  42.55 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3612  Trp operon repressor  42.55 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0550  Trp repressor  28 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3676  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 115 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1301  Trp operon repressor  35.09 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000284833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3870  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0526  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04234  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5908  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.993559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4945  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4941  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04269  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3663  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4992  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4629  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3419  trp operon repressor  35.09 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3089  Trp operon repressor  35.09 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000354665  hitchhiker  0.00665202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1268  Trp operon repressor  35.09 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633975  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4941  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4993  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.873782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4834  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4907  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4995  Trp operon repressor  40.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1224  Trp operon repressor  35.09 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3604  Trp operon repressor  39.22 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1755  TrpR like protein, YerC/YecD  34.55 
 
 		 102 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.0261273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>