51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0565 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0565  Trp operon repressor  100 
 
 
110 aa  224  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0676  Trp operon repressor  69.52 
 
 
109 aa  144  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107752  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3870  Trp operon repressor  72.22 
 
 
115 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3676  Trp operon repressor  74.29 
 
 
115 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0526  Trp operon repressor  66.36 
 
 
110 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0815  Trp operon repressor  69.9 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3612  Trp operon repressor  69.9 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3482  Trp operon repressor  69.9 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0554  Trp operon repressor  62.5 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4993  Trp operon repressor  63.81 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.873782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4941  Trp operon repressor  63.81 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4834  Trp operon repressor  63.81 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4907  Trp operon repressor  63.81 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4995  Trp operon repressor  63.81 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4941  Trp operon repressor  62.62 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3663  Trp operon repressor  62.62 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5908  Trp operon repressor  62.62 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.993559  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04234  hypothetical protein  62.62 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4629  Trp operon repressor  62.62 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4992  Trp operon repressor  62.62 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04269  Trp operon repressor  62.62 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4945  Trp operon repressor  62.62 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3604  Trp operon repressor  64.95 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0231  Trp operon repressor  53.41 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0659  Trp operon repressor  48.78 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00999  Trp operon repressor  53.25 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004400  Trp operon repressor-like protein  46.84 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0621  Trp operon repressor  42.7 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1090  Trp operon repressor  44.57 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1566  Trp operon repressor  42.7 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2909  Trp operon repressor  47.37 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1076  Trp operon repressor  40.79 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000888346  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0902  putative Trp operon repressor  50.94 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.478424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1301  Trp operon repressor  39.71 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000284833  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3419  trp operon repressor  47.37 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1224  Trp operon repressor  39.71 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1136  Trp operon repressor  47.37 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1268  Trp operon repressor  39.71 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1206  Trp operon repressor  47.37 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000153675  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3089  Trp operon repressor  39.71 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000354665  hitchhiker  0.00665202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1135  Trp operon repressor  47.37 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1666  Trp operon repressor  41.38 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  45.45 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1922  Trp operon repressor  35 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2737  Trp operon repressor  43.75 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000312745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1172  Trp operon repressor  44.19 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2743  Trp repressor  45.65 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0924  Trp operon repressor  35.82 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1155  Trp operon repressor  40 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000693616  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1063  Trp operon repressor  44.19 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.844988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1267  Trp operon repressor  44.19 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.885699  hitchhiker  0.00351193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>