21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0935 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0935  Trp operon repressor  100 
 
 
100 aa  201  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0550  Trp repressor  36.96 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0621  Trp operon repressor  41.79 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1566  Trp operon repressor  41.79 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  36.62 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1155  Trp operon repressor  34.94 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000693616  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0676  Trp operon repressor  36.36 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107752  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1666  Trp operon repressor  38.67 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3676  Trp operon repressor  36.51 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3870  Trp operon repressor  36.51 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0526  Trp operon repressor  32.81 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4945  Trp operon repressor  37.5 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3604  Trp operon repressor  44.68 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0554  Trp operon repressor  33.85 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4629  Trp operon repressor  44.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4992  Trp operon repressor  44.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04269  Trp operon repressor  44.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3663  Trp operon repressor  44.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4941  Trp operon repressor  44.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5908  Trp operon repressor  44.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.993559  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04234  hypothetical protein  44.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>