36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1388 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1388  TrpR like protein, YerC/YecD  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0536  TrpR like protein, YerC/YecD  79.12 
 
 		 100 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1455  TrpR like protein, YerC/YecD  71.88 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00161853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02030  TrpR like protein, YerC/YecD  72.04 
 
 		 95 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2643  TrpR-like protein YerC/YecD  69.89 
 
 		 99 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2329  TrpR-like protein YerC/YecD  66.67 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1764  TrpR like protein, YerC/YecD  61.46 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2038  Trp repressor  67.74 
 
 		 99 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0748  TrpR like protein, YerC/YecD  61.46 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2360  TrpR like protein, YerC/YecD  63.04 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2379  TrpR like protein, YerC/YecD  65.12 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000677773  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0983  TrpR like protein, YerC/YecD  57.45 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1354  TrpR like protein, YerC/YecD  59.14 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1144  TrpR like protein, YerC/YecD  63.33 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0268  TrpR like protein, YerC/YecD  62.22 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000519773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1488  TrpR like protein, YerC/YecD  56.7 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1996  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0460  TrpR like protein, YerC/YecD  53.76 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1962  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1445  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0979  TrpR like protein, YerC/YecD  58.06 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000286042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0312  TrpR like protein, YerC/YecD  56.25 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000114687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1771  hypothetical protein  56.52 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1060  TrpR like protein, YerC/YecD  54.74 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01570  TrpR-related protein YerC/YecD  44.68 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144549  normal  0.996095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01780  TrpR-related protein YerC/YecD  43.82 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269609 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1209  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1203  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0381  TrpR like protein, YerC/YecD  42.7 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1755  TrpR like protein, YerC/YecD  41.1 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0713  TrpR like protein, YerC/YecD  48 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000346456 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00831  putative TrpR-like protein YerC/YecD  39.24 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00135895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1616  TrpR like protein, YerC/YecD  42.86 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1354  TrpR like protein, YerC/YecD  40.32 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1421  hypothetical protein  40.32 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09650  TrpR-related protein YerC/YecD  32.91 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.077354  normal  0.07055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>