36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0979 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0979  TrpR like protein, YerC/YecD  100 
 
 
100 aa  201  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000286042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0312  TrpR like protein, YerC/YecD  73.4 
 
 
96 aa  145  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000114687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02030  TrpR like protein, YerC/YecD  59.14 
 
 
95 aa  116  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1388  TrpR like protein, YerC/YecD  58.06 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2038  Trp repressor  59.57 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0536  TrpR like protein, YerC/YecD  58.51 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0460  TrpR like protein, YerC/YecD  55.56 
 
 
122 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2360  TrpR like protein, YerC/YecD  54.44 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1771  hypothetical protein  54.44 
 
 
103 aa  105  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1488  TrpR like protein, YerC/YecD  57.14 
 
 
113 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0748  TrpR like protein, YerC/YecD  55.56 
 
 
103 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1455  TrpR like protein, YerC/YecD  53.19 
 
 
102 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00161853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1764  TrpR like protein, YerC/YecD  52.58 
 
 
103 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1060  TrpR like protein, YerC/YecD  56.67 
 
 
99 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2379  TrpR like protein, YerC/YecD  52.75 
 
 
109 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000677773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0268  TrpR like protein, YerC/YecD  53.26 
 
 
106 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000519773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1144  TrpR like protein, YerC/YecD  53.85 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2643  TrpR-like protein YerC/YecD  52.22 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1996  hypothetical protein  47.62 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2329  TrpR-like protein YerC/YecD  50.55 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1962  hypothetical protein  47.62 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1445  hypothetical protein  48.81 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1354  TrpR like protein, YerC/YecD  45.36 
 
 
105 aa  91.3  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0983  TrpR like protein, YerC/YecD  48.35 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0381  TrpR like protein, YerC/YecD  48.84 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01570  TrpR-related protein YerC/YecD  45.12 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144549  normal  0.996095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01780  TrpR-related protein YerC/YecD  40.91 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269609 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1209  hypothetical protein  35.16 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1203  hypothetical protein  35.16 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0713  TrpR like protein, YerC/YecD  44.87 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000346456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1616  TrpR like protein, YerC/YecD  44.05 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405798  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1755  TrpR like protein, YerC/YecD  42.86 
 
 
102 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09650  TrpR-related protein YerC/YecD  36.71 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.077354  normal  0.07055 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1354  TrpR like protein, YerC/YecD  43.94 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1421  hypothetical protein  43.94 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00831  putative TrpR-like protein YerC/YecD  37.97 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00135895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>