28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_R0042 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 90 bp  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0034  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0013  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.694217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0020  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0032  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241794  hitchhiker  0.000000080319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0033  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323834  hitchhiker  0.00000000664377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0015  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0091  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000323323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0087  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000189881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0065  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0064  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  83.13 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0042  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0038  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000026023  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309197  tRNA-Ser  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159743  normal  0.113678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0044  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0002  tRNA-Ser  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0034  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000142144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>