124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0034 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  86.9 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0014  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00196818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0042  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0044  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0064  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0065  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0087  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000189881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4242  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0054  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000530132  hitchhiker  0.00450232 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3212  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000867673  hitchhiker  0.00385605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0070  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0004  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489896  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0013  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.694217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0059  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0067  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0084  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0117481  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0006  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0015  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0032  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241794  hitchhiker  0.000000080319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0033  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323834  hitchhiker  0.00000000664377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60250  tRNA-Ser  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t060  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00263589  hitchhiker  0.000000337052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t061  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011458  hitchhiker  0.000000339916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t070  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130156  normal  0.270394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>