14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3425 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  100 
 
 
145 aa  284  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  47.95 
 
 
150 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  46.21 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  41.09 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  38.98 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  35.38 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  35.48 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  34.88 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  37.01 
 
 
178 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  35.66 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  38.36 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  32.03 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>