14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2228 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  100 
 
 		 150 aa  288  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  47.95 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  47.83 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  44.12 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  38.69 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  38.93 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  39.39 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  35.09 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  33.59 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  37.69 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  36.04 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  37.8 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  33.01 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>