16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4136 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  100 
 
 
149 aa  293  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1312  hypothetical protein  40.56 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8209  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  34.59 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  34.81 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  36.57 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  31.5 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  36.72 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  38.36 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  32.82 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  34.06 
 
 
141 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  31.2 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  37.04 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  34.85 
 
 
144 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  32.1 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.283918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>