18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2588 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  344  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  86.36 
 
 
143 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  46.56 
 
 
133 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  49.17 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  40.98 
 
 
137 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  46.25 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  34.72 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  36.96 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  35.71 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1312  hypothetical protein  31.16 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  38.1 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  36.62 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  37.8 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  37.31 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  37.8 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8209  hypothetical protein  29.7 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>