11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4450 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  310  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  97.79 
 
 		 144 aa  233  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  40.91 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  39.42 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  38.76 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  34.88 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  36 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  29.32 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>