17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1229 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  50.56 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  47.62 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  42.75 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  40.32 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  40.98 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  43.08 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  38.05 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  34.81 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  41.76 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  35.48 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  35.71 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  39.81 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  35.09 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4720  hypothetical protein  37.19 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  37.04 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>