14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4038 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  235  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  49.57 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  50.42 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  49.57 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  41.32 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  34.53 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  44.83 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  46.09 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  38.98 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  33.07 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  42.34 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  41.33 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>