16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2983 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2983  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  818    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232852  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3060  hypothetical protein  42.75 
 
 
405 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.956614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6470  hypothetical protein  30.19 
 
 
398 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0718502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1673  hypothetical protein  26.05 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3278  hypothetical protein  36.2 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0145  hypothetical protein  28.54 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05270  hypothetical protein  27.68 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.906324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3934  hypothetical protein  26.56 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0375  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0847  hypothetical protein  34.23 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153613  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1311  hypothetical protein  33.09 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1267  hypothetical protein  23.48 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1540  hypothetical protein  34.48 
 
 
408 aa  59.7  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0100  hypothetical protein  28.69 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3990  hypothetical protein  27.93 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.323744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2333  hypothetical protein  30.91 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>