16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1267 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1267  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  866    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0100  hypothetical protein  40.85 
 
 
426 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1673  hypothetical protein  29.37 
 
 
409 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484523 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0145  hypothetical protein  29.04 
 
 
407 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1311  hypothetical protein  28.25 
 
 
412 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0375  hypothetical protein  28.13 
 
 
396 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3934  hypothetical protein  27.82 
 
 
407 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0847  hypothetical protein  27.48 
 
 
408 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153613  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3278  hypothetical protein  23.98 
 
 
397 aa  120  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1540  hypothetical protein  25.52 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05270  hypothetical protein  24.94 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.906324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3990  hypothetical protein  24.37 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.323744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2333  hypothetical protein  23.88 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2983  hypothetical protein  23.48 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232852  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3060  hypothetical protein  25.61 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.956614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6470  hypothetical protein  21.23 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0718502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>