16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0375 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0375  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  800    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1311  hypothetical protein  39.56 
 
 
412 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0847  hypothetical protein  41.22 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153613  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1673  hypothetical protein  36.76 
 
 
409 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484523 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0145  hypothetical protein  36.97 
 
 
407 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3934  hypothetical protein  38.88 
 
 
407 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1540  hypothetical protein  33.99 
 
 
408 aa  209  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3278  hypothetical protein  36.62 
 
 
397 aa  200  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05270  hypothetical protein  33.65 
 
 
417 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.906324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2333  hypothetical protein  32.99 
 
 
385 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1267  hypothetical protein  28.13 
 
 
416 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0100  hypothetical protein  28.15 
 
 
426 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3990  hypothetical protein  26.71 
 
 
409 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.323744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3060  hypothetical protein  30.11 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.956614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2983  hypothetical protein  31.11 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232852  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6470  hypothetical protein  28.96 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0718502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>