16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05270 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05270  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  818    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.906324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3278  hypothetical protein  42.79 
 
 
397 aa  256  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0145  hypothetical protein  35.06 
 
 
407 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1673  hypothetical protein  32.24 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1540  hypothetical protein  34.34 
 
 
408 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0375  hypothetical protein  33.65 
 
 
396 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1311  hypothetical protein  33.02 
 
 
412 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3934  hypothetical protein  34.27 
 
 
407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2333  hypothetical protein  36.23 
 
 
385 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0847  hypothetical protein  30 
 
 
408 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153613  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1267  hypothetical protein  24.94 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3060  hypothetical protein  27.02 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.956614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2983  hypothetical protein  27.9 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232852  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3990  hypothetical protein  28.28 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.323744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0100  hypothetical protein  25.77 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6470  hypothetical protein  30.14 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0718502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>