16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3934 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3934  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0145  hypothetical protein  46.27 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1540  hypothetical protein  43.49 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1673  hypothetical protein  38.39 
 
 		 409 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0375  hypothetical protein  38.88 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1311  hypothetical protein  36.19 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3278  hypothetical protein  36.45 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0847  hypothetical protein  35.28 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05270  hypothetical protein  34.03 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.906324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3990  hypothetical protein  28.88 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.323744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2333  hypothetical protein  29.18 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1267  hypothetical protein  27.82 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0100  hypothetical protein  26.91 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2983  hypothetical protein  26.56 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232852  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6470  hypothetical protein  29.3 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0718502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3060  hypothetical protein  36.45 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.956614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>