16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6470 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6470  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0718502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3060  hypothetical protein  31.18 
 
 
405 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.956614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2983  hypothetical protein  30.19 
 
 
405 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232852  normal  0.341305 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1673  hypothetical protein  25.06 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1540  hypothetical protein  23.19 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3934  hypothetical protein  29.3 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0847  hypothetical protein  28.29 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153613  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0375  hypothetical protein  28.96 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1311  hypothetical protein  32.84 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3278  hypothetical protein  35.82 
 
 
397 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1267  hypothetical protein  21.23 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05270  hypothetical protein  30.14 
 
 
417 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.906324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0100  hypothetical protein  30.74 
 
 
426 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2333  hypothetical protein  27.27 
 
 
385 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3990  hypothetical protein  30.37 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.323744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>