More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1021 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1021  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
125 aa  254  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0932  50S ribosomal protein L19  61.6 
 
 
125 aa  165  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.123907  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0004  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 
121 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 
121 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  54.78 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
115 aa  130  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
117 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  50.81 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  50.81 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  54.39 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  54.39 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  51.72 
 
 
130 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
121 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
118 aa  127  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
128 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
130 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
117 aa  127  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  50 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  52.94 
 
 
135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  49.14 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  49.14 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  49.59 
 
 
128 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
130 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
127 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
117 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
117 aa  124  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  51.72 
 
 
117 aa  124  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1162  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
117 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000263892  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 
128 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  50 
 
 
146 aa  123  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
120 aa  123  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1257  50S ribosomal protein L19  50.85 
 
 
117 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  hitchhiker  0.0000525185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  45.9 
 
 
163 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  54.29 
 
 
119 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1066  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
116 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000285851  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  48.7 
 
 
124 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
130 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  48.36 
 
 
132 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  49.15 
 
 
118 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  47.15 
 
 
131 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
129 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
117 aa  120  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1052  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  120  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000268898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  49.14 
 
 
115 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
129 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
128 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 
130 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
113 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  46.34 
 
 
131 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.2335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>