17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5016 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008771  Veis_5016  zeta toxin family protein  100 
 
 
365 aa  742    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4239  zeta toxin family protein  34.31 
 
 
560 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906511  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6819  zeta toxin family protein  31.2 
 
 
659 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4336  zeta toxin  28.57 
 
 
586 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0360  Zeta toxin family protein  28.83 
 
 
270 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0194178  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0158  zeta toxin superfamily protein  27.64 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00432306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0420  Sigma 54 interacting domain protein  27.62 
 
 
256 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.482221  hitchhiker  0.00000000444623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2358  zeta toxin  29.63 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519166  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6379  zeta toxin family protein  27.54 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2837  hypothetical protein  29.52 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4262  putative zeta toxin  29.68 
 
 
308 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.484373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4571  putative zeta toxin  29.68 
 
 
308 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4193  Zeta toxin family protein  28.65 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0914  Zeta toxin family protein  30.26 
 
 
149 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1822  zeta toxin family protein  32 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.603428  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1712  zeta toxin family protein  30.89 
 
 
238 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2841  zeta toxin  24.86 
 
 
450 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>