16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4571 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4262  putative zeta toxin  100 
 
 
308 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.484373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4571  putative zeta toxin  100 
 
 
308 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0420  Sigma 54 interacting domain protein  33.33 
 
 
256 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.482221  hitchhiker  0.00000000444623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0360  Zeta toxin family protein  33.52 
 
 
270 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0194178  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0158  zeta toxin superfamily protein  31.94 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00432306  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4239  zeta toxin family protein  28.65 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906511  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4336  zeta toxin  28.41 
 
 
586 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0914  Zeta toxin family protein  39.6 
 
 
149 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6819  zeta toxin family protein  27.15 
 
 
659 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4193  Zeta toxin family protein  24.64 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5016  zeta toxin family protein  29.68 
 
 
365 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03110  Zeta toxin  27.33 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.562718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6379  zeta toxin family protein  21.43 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2993  Zeta toxin family protein  27.13 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2358  zeta toxin  23.84 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519166  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2343  hypothetical protein  23.98 
 
 
243 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194431  hitchhiker  0.0000304739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>