16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0360 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0360  Zeta toxin family protein  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0194178  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4239  zeta toxin family protein  30.96 
 
 
560 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906511  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4262  putative zeta toxin  33.52 
 
 
308 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.484373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4571  putative zeta toxin  33.52 
 
 
308 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6819  zeta toxin family protein  26.67 
 
 
659 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0420  Sigma 54 interacting domain protein  30.17 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.482221  hitchhiker  0.00000000444623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6379  zeta toxin family protein  30.85 
 
 
383 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4336  zeta toxin  27.98 
 
 
586 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2358  zeta toxin  25.75 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519166  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2837  hypothetical protein  27.78 
 
 
410 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5016  zeta toxin family protein  28.83 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0158  zeta toxin superfamily protein  28.57 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00432306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0914  Zeta toxin family protein  33.73 
 
 
149 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4193  Zeta toxin family protein  22.39 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2751  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  34.65 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2624  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  34.65 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>