228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4878 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4878  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
140 aa  290  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2994  transposase (IS4)  97.14 
 
 
212 aa  137  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486834  normal  0.519471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  54.69 
 
 
372 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  54.69 
 
 
372 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  51.47 
 
 
290 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  54.69 
 
 
372 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  54.69 
 
 
372 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  51.47 
 
 
374 aa  133  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  51.47 
 
 
374 aa  133  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3736  transposase, IS4 family protein  53.85 
 
 
162 aa  133  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  49.3 
 
 
374 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4881  transposase, IS4 family protein  53.15 
 
 
278 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2582  transposase IS4 family protein  51.88 
 
 
193 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.459913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  50.38 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  48.59 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  50.38 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  49.62 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  49.62 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4297  transposase, IS4 family protein  52.45 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  49.62 
 
 
253 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  49.62 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  49.62 
 
 
378 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  48.2 
 
 
370 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2610  transposase, IS4 family protein  51.8 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  50.75 
 
 
258 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  50.75 
 
 
263 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  50 
 
 
378 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  50.38 
 
 
263 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  48.87 
 
 
378 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  48.87 
 
 
378 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  51.88 
 
 
373 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  48.87 
 
 
378 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  48.15 
 
 
373 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  48.87 
 
 
378 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  52.17 
 
 
381 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  52.17 
 
 
381 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  52.17 
 
 
381 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  49.62 
 
 
263 aa  124  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  48.87 
 
 
378 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  48.87 
 
 
378 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  48.12 
 
 
253 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  48.12 
 
 
253 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  48.12 
 
 
253 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  48.12 
 
 
253 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  47.86 
 
 
374 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  47.14 
 
 
374 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  47.14 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  47.14 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  48.87 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  48.12 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  46.72 
 
 
388 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  46.72 
 
 
388 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  46.72 
 
 
388 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  46.72 
 
 
388 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  46.72 
 
 
388 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  46.72 
 
 
388 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  46.72 
 
 
388 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  47.48 
 
 
248 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  47.48 
 
 
248 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  43.45 
 
 
333 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  49.22 
 
 
230 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0195  IS1548 transposase  42.96 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0693  IS1548 transposase  42.96 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0760  IS1548 transposase  42.96 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0522474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0945  IS1548 transposase  42.96 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00403728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1584  IS1548 transposase  42.96 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1619  IS1548 transposase  42.96 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  45.04 
 
 
362 aa  110  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  45.52 
 
 
327 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  48.2 
 
 
390 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5802  transposase ISAs1 family protein  42.96 
 
 
377 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  42.96 
 
 
377 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5528  transposase ISAs1 family protein  42.96 
 
 
377 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0898729 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5401  transposase ISAs1 family protein  42.96 
 
 
377 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5630  transposase ISAs1 family protein  42.96 
 
 
377 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000338804 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  42.96 
 
 
377 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5832  transposase ISAs1 family protein  42.96 
 
 
377 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  37.34 
 
 
393 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3953  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
222 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3080  transposase IS4 family protein  53.68 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4269  transposase IS4 family protein  42.65 
 
 
342 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  40.29 
 
 
366 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_002950  PG0277  ISPg2, transposase  40.6 
 
 
376 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0865  ISPg2, transposase  40.6 
 
 
376 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233065 
 
 
-
 
NC_002950  PG1350  ISPg2, transposase  40.6 
 
 
376 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1746  ISPg2, transposase  40.6 
 
 
376 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2176  ISPg2, transposase  40.6 
 
 
376 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1741  IS4 family transposase  41.18 
 
 
381 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0779  IS4 family transposase  41.18 
 
 
381 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.44414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1672  IS4 family transposase  41.18 
 
 
381 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.56828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>