37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3856 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3856  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6745  hypothetical protein  43.52 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00221368  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29.59 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.61 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  32.69 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.61 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1813  hypothetical protein  33.01 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  38.75 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2601  hypothetical protein  37.33 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  31.03 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  32.99 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  26.67 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  35.06 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  28.21 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.18 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3869  hypothetical protein  39.73 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.77 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  27.62 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  28 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  40.58 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  26.67 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  38.16 
 
 
417 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31.17 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  28.43 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.29 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  30.85 
 
 
550 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  30.68 
 
 
576 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.92 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  30.93 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  32.43 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  31.82 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  29.79 
 
 
550 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  29.79 
 
 
550 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  30.49 
 
 
182 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>