15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0684 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0684  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  63.93 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1303  general secretion pathway protein I  43.41 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1523  putative pseudopilin I precursor  31.54 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  31.91 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1118  general secretory pathway protein I  35.83 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0860  general secretory pathway protein I precursor  36.97 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.1118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0773  general secretion pathway protein I  36.97 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  32.08 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3313  general secretion pathway protein I, putative  34.12 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3147  general secretion pathway protein I, putative  34.12 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02680  general secretion pathway protein I  34.4 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0550  type II secretory pathway pseudopilin  32.58 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2179  general secretion pathway protein GspI  36 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  56.41 
 
 		 223 aa  40.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>