16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02680 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02680  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0860  general secretory pathway protein I precursor  58.82 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.1118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0773  general secretion pathway protein I  58.82 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0550  type II secretory pathway pseudopilin  55.56 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  34.21 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1118  general secretory pathway protein I  35.38 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0684  general secretion pathway protein I  34.4 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  33.72 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1523  putative pseudopilin I precursor  32.58 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2179  general secretion pathway protein GspI  37.35 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3313  general secretion pathway protein I, putative  28.8 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1303  general secretion pathway protein I  27.71 
 
 		 134 aa  43.5  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1548  N-terminal methylation  32 
 
 		 132 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0678  hypothetical protein  26.27 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3147  general secretion pathway protein I, putative  26.56 
 
 		 123 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  35.79 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>