13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0860 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0860  general secretory pathway protein I precursor  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.1118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0773  general secretion pathway protein I  97.73 
 
 		 132 aa  222  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02680  general secretion pathway protein I  58.82 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0550  type II secretory pathway pseudopilin  51.52 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0684  general secretion pathway protein I  36.97 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  37.21 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1118  general secretory pathway protein I  33.33 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1523  putative pseudopilin I precursor  30.63 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2776  hypothetical protein  32.06 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2179  general secretion pathway protein GspI  30 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0890  hypothetical protein  31.71 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  50 
 
 		 182 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>