20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0550 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0550  type II secretory pathway pseudopilin  100 
 
 
139 aa  266  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02680  general secretion pathway protein I  55.56 
 
 
138 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0860  general secretory pathway protein I precursor  51.52 
 
 
132 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.1118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0773  general secretion pathway protein I  50.75 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  39.77 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0684  general secretion pathway protein I  32.58 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  33.88 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1523  putative pseudopilin I precursor  36.14 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1165  hypothetical protein  28.97 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.439342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1825  hypothetical protein  43.55 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1353  GspI/GspJ family type II secretion system protein  27.1 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0972416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2179  general secretion pathway protein GspI  40.51 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1135  Tfp pilus assembly protein  26.92 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0890  hypothetical protein  31.16 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0399  methylation site containing protein  40.35 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.464291  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1303  general secretion pathway protein I  28.57 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0186089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  37.23 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  34.21 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1118  general secretory pathway protein I  30.58 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>