21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4268 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4268  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  896    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1739  hypothetical protein  49.62 
 
 		 451 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000894405  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5235  hypothetical protein  50.64 
 
 		 452 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2311  hypothetical protein  51.35 
 
 		 1060 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0997  hypothetical protein  51.36 
 
 		 441 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.525833  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1083  hypothetical protein  51.36 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0504  hypothetical protein  51.09 
 
 		 420 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0144  hypothetical protein  51.09 
 
 		 420 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1467  hypothetical protein  51.09 
 
 		 420 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1390  hypothetical protein  51.09 
 
 		 420 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0274  hypothetical protein  45.73 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3604  hypothetical protein  45.85 
 
 		 404 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157487 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4220  hypothetical protein  47.42 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1325  hypothetical protein  45.13 
 
 		 391 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0624477  normal  0.52025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1165  hypothetical protein  44.87 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.494476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2182  hypothetical protein  38.9 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0487903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0057  hypothetical protein  32.4 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1478  hypothetical protein  34.82 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33620  hypothetical protein  31.07 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19020  hypothetical protein  32.53 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  25.33 
 
 		 1887 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>