21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5235 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5235  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  907    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1739  hypothetical protein  70.02 
 
 
451 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000894405  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2311  hypothetical protein  68.97 
 
 
1060 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1083  hypothetical protein  69.21 
 
 
441 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0997  hypothetical protein  69.21 
 
 
441 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.525833  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0504  hypothetical protein  70.05 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0144  hypothetical protein  70.05 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1467  hypothetical protein  70.05 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1390  hypothetical protein  70.05 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4268  hypothetical protein  50.5 
 
 
449 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4220  hypothetical protein  49.73 
 
 
389 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0274  hypothetical protein  47.67 
 
 
394 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1325  hypothetical protein  47.41 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0624477  normal  0.52025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3604  hypothetical protein  45.04 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0157487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1165  hypothetical protein  46.89 
 
 
391 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.494476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2182  hypothetical protein  39.67 
 
 
407 aa  196  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0487903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0057  hypothetical protein  33.41 
 
 
488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1478  hypothetical protein  34.73 
 
 
404 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19020  hypothetical protein  34.04 
 
 
439 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33620  hypothetical protein  33.16 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  27.17 
 
 
1887 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>