21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1739 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1739  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000894405  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5235  hypothetical protein  69.13 
 
 		 452 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2311  hypothetical protein  68.1 
 
 		 1060 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0504  hypothetical protein  67.76 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0144  hypothetical protein  67.76 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0997  hypothetical protein  68.01 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.525833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1467  hypothetical protein  67.76 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1390  hypothetical protein  67.76 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1083  hypothetical protein  68.01 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4268  hypothetical protein  49.62 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1325  hypothetical protein  47.34 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0624477  normal  0.52025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1165  hypothetical protein  47.07 
 
 		 391 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.494476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3604  hypothetical protein  43.58 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0274  hypothetical protein  46.28 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4220  hypothetical protein  46.17 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2182  hypothetical protein  37.84 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0487903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 488 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1478  hypothetical protein  33.91 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33620  hypothetical protein  33.61 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19020  hypothetical protein  31.12 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  28.33 
 
 		 1887 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>