21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2311 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2311  hypothetical protein  100 
 
 
1060 aa  1992    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0504  hypothetical protein  99.05 
 
 
420 aa  841    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0144  hypothetical protein  99.05 
 
 
420 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1083  hypothetical protein  99.55 
 
 
441 aa  886    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0997  hypothetical protein  99.55 
 
 
441 aa  886    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.525833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1467  hypothetical protein  99.05 
 
 
420 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1390  hypothetical protein  99.05 
 
 
420 aa  841    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1739  hypothetical protein  68.1 
 
 
451 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000894405  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5235  hypothetical protein  72.61 
 
 
452 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4268  hypothetical protein  51.35 
 
 
449 aa  301  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3604  hypothetical protein  46.9 
 
 
404 aa  291  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0157487 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4220  hypothetical protein  50.69 
 
 
389 aa  282  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1165  hypothetical protein  46.44 
 
 
391 aa  253  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.494476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1325  hypothetical protein  46.7 
 
 
391 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0624477  normal  0.52025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0274  hypothetical protein  46.44 
 
 
394 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2182  hypothetical protein  40.49 
 
 
407 aa  168  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0487903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0057  hypothetical protein  35 
 
 
488 aa  150  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1478  hypothetical protein  34.65 
 
 
404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19020  hypothetical protein  33.77 
 
 
439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33620  hypothetical protein  35.28 
 
 
426 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  30.36 
 
 
1887 aa  62  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>