21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4220 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4220  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  780    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3604  hypothetical protein  70.28 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1165  hypothetical protein  55.91 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.494476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0274  hypothetical protein  55.53 
 
 		 394 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1325  hypothetical protein  55.91 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0624477  normal  0.52025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1739  hypothetical protein  46.17 
 
 		 451 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000894405  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5235  hypothetical protein  49.73 
 
 		 452 aa  316  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2311  hypothetical protein  50.69 
 
 		 1060 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4268  hypothetical protein  47.42 
 
 		 449 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0997  hypothetical protein  49.73 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.525833  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1083  hypothetical protein  50.69 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0504  hypothetical protein  50.14 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0144  hypothetical protein  50.14 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1467  hypothetical protein  50.14 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1390  hypothetical protein  50.14 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2182  hypothetical protein  41.42 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0487903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1478  hypothetical protein  32.27 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0057  hypothetical protein  32.11 
 
 		 488 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19020  hypothetical protein  31.99 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33620  hypothetical protein  31.93 
 
 		 426 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  27.42 
 
 		 1887 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>