21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33620  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  836    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1478  hypothetical protein  42.67 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19020  hypothetical protein  39.47 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0057  hypothetical protein  34.64 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1739  hypothetical protein  33.61 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000894405  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5235  hypothetical protein  34.18 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1083  hypothetical protein  36.57 
 
 		 441 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0997  hypothetical protein  36.57 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.525833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2311  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1060 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0144  hypothetical protein  36.57 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1467  hypothetical protein  36.57 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3604  hypothetical protein  32.67 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157487 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0504  hypothetical protein  36.57 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1390  hypothetical protein  36.57 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4268  hypothetical protein  30.97 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1325  hypothetical protein  34.48 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0624477  normal  0.52025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1165  hypothetical protein  33.79 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.494476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0274  hypothetical protein  33.56 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4220  hypothetical protein  32.77 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  25.66 
 
 		 1887 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2182  hypothetical protein  28.46 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0487903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>