More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2637 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2637  Asparaginase  100 
 
 		 329 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2993  asparaginase  60.3 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  62.42 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1919  asparaginase  58.57 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  59.02 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  58.1 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4896  asparaginase  60.5 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.970044  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2559  asparaginase/glutaminase  56.39 
 
 		 325 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0847476  normal  0.0141583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2081  asparaginase  53.44 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.438459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1865  asparaginase  56.33 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3566  asparaginase  49.84 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188072  hitchhiker  0.00798524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  47.42 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  48.15 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  47.68 
 
 		 340 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  47.68 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  46.36 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  46.06 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  47.26 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  47.26 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  47.48 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  48.91 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  46.86 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  46.13 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  45.77 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  46.25 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  48.75 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  43.07 
 
 		 347 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  46.2 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  46.2 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  45.67 
 
 		 396 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  46.2 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  46.2 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  46.2 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  46.2 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  39.38 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  37.8 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  36.67 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  37.8 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  37.8 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  37.8 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  37.8 
 
 		 347 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  37.8 
 
 		 347 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  37.27 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  35.95 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  40.91 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  36.65 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  37.04 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  40.18 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  36.34 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  35.82 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  35.52 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  35.52 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  35.89 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  34.66 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  35.89 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  34.73 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  36.84 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  36.78 
 
 		 348 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  37.54 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  35.91 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  37.5 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  37.5 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  35.69 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  40 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  36.43 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  39.51 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  36.73 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  37.65 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  37.17 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  35.38 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  38.04 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  33.23 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2339  Asparaginase  39.24 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  37.05 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  35.8 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.589872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0801  Asparaginase  39.94 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  35.19 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  35.19 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  36.08 
 
 		 348 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  36.45 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  36.08 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  36.45 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  36.08 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  35.76 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4206  L-asparaginases, type II  35.17 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  33.33 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  35.76 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  35.76 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  35.76 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  35.76 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  35.76 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  35.44 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  38.04 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  34.81 
 
 		 348 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  34.81 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0419  asparaginase/glutaminase  36.8 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000749925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  34.81 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  34.81 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4182  L-asparaginases, type II  36.19 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428323  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  34.81 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0792755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>