69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05884 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05884  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02579  hypothetical protein  94 
 
 
399 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02811  hypothetical protein  94 
 
 
399 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08194  transposase  94 
 
 
399 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.679296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01925  hypothetical protein  94 
 
 
399 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01664  hypothetical protein  94 
 
 
399 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01470  hypothetical protein  94 
 
 
399 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01477  hypothetical protein  92 
 
 
212 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02009  hypothetical protein  92 
 
 
405 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05982  hypothetical protein  92 
 
 
399 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05054  hypothetical protein  92 
 
 
399 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06074  hypothetical protein  92 
 
 
399 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02494  hypothetical protein  92 
 
 
399 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02007  hypothetical protein  92 
 
 
399 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02577  hypothetical protein  90 
 
 
312 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02588  hypothetical protein  88 
 
 
72 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  57.14 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  57.14 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  57.14 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  57.14 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  57.14 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06245  hypothetical protein  79.17 
 
 
238 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1949  putative transposase  55.1 
 
 
224 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  55.1 
 
 
402 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02596  hypothetical protein  87.88 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  55.1 
 
 
402 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  55.1 
 
 
402 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  55.1 
 
 
420 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  55.1 
 
 
402 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  55.1 
 
 
402 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  55.1 
 
 
400 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  55.1 
 
 
400 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  55.1 
 
 
400 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  55.1 
 
 
400 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  53.06 
 
 
420 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  53.06 
 
 
402 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  53.06 
 
 
402 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1849  putative transposase  53.06 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0731  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1974  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0146  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1244  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1541  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2226  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2283  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3499  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3567  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3625  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4239  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.4  transposase  45.83 
 
 
334 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4437  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0102  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0136  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4000  ISSod3, transposase  45.83 
 
 
404 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4432  ISSod3, transposase  43.75 
 
 
404 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2465  IS4 family transposase  43.75 
 
 
404 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000609587  hitchhiker  0.0000155014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  48 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1636  transposase, IS4 family protein  43.48 
 
 
460 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>