237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02687 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  64.82 
 
 		 554 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  64.82 
 
 		 554 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  66.59 
 
 		 554 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02687  2-keto-3-deoxygluconate permease  100 
 
 		 499 aa  1043    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  94.69 
 
 		 553 aa  906    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  65.27 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  66.15 
 
 		 552 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  64.38 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  66.37 
 
 		 552 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  63.72 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  64.38 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  64.6 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  64.82 
 
 		 554 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  65.04 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  64.6 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  64.76 
 
 		 554 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  62.61 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  61.5 
 
 		 552 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  60.35 
 
 		 550 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  59.91 
 
 		 550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  60.09 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  60.09 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  60.09 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  60.09 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  60.09 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  60.13 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  59.91 
 
 		 550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  60.09 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  59.87 
 
 		 550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  59.69 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  59.91 
 
 		 550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  59.91 
 
 		 550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  59.6 
 
 		 565 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  59.87 
 
 		 550 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  58.94 
 
 		 550 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  59.38 
 
 		 550 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  58.72 
 
 		 550 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  58.94 
 
 		 550 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  58.94 
 
 		 550 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  59.38 
 
 		 550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  58.28 
 
 		 550 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  46.9 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  46.9 
 
 		 557 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  48.45 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  48.79 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  48.01 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  47.57 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  47.57 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  46.68 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  48.23 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  45.35 
 
 		 553 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  48.01 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  48.89 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  45.7 
 
 		 559 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  47.25 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  47.36 
 
 		 549 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  47.25 
 
 		 537 aa  412  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  45.82 
 
 		 565 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  45.58 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  46.46 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  45.8 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  46.48 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  45.59 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  43.67 
 
 		 546 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  45.8 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  44.91 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  43.35 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  44.86 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  45.15 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  45.15 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  44.04 
 
 		 566 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  45.03 
 
 		 531 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  42.95 
 
 		 555 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  44.03 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  43.2 
 
 		 547 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  43.79 
 
 		 549 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  41.5 
 
 		 549 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  45.15 
 
 		 531 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  41.45 
 
 		 545 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  41.23 
 
 		 545 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  43.08 
 
 		 548 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  42.17 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  39.7 
 
 		 543 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  41.39 
 
 		 549 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  39.83 
 
 		 555 aa  346  7e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  40.13 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  42.48 
 
 		 549 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  43.57 
 
 		 549 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  42.15 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  41.65 
 
 		 551 aa  337  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  40.13 
 
 		 539 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  41.99 
 
 		 525 aa  332  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2847  2-keto-3-deoxygluconate permease  42.34 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  40.61 
 
 		 547 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  40.13 
 
 		 551 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  40.56 
 
 		 542 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  40.39 
 
 		 547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  39.96 
 
 		 547 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  41.13 
 
 		 552 aa  324  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  37.92 
 
 		 568 aa  319  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>