More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01763 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01763  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55000  ABC transporter periplasmic protein  35.46 
 
 
316 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300929  unclonable  2.23154e-21 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  32.71 
 
 
332 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  25.49 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  29.13 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.48 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.99 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.38 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.03 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.03 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.03 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.67 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.03 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  23.67 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.03 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
662 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.47 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  24.17 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  23.76 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.22 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  26.17 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  22.85 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  24.54 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  25.58 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  22.85 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.47 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.47 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.85 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
311 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  23.18 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  22.52 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  22.52 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  22.52 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  22.52 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  23.25 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  23.94 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.35 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.35 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  23.94 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  22.19 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.72 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.35 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.15 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3188  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  26.57 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  23.78 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.89 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.37 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  26.89 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  26.47 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  26.47 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.47 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  26.47 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3485  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  25.35 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.24697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3245  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  26.1 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000144185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.47 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1776  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.52 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0264825  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.84 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.07 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  24.63 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  24.54 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.84 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  24.63 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  26.47 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  23.53 
 
 
365 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  24.72 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  25.44 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  21.74 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  21.74 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3489  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.63 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3185  periplasmic binding protein  26.1 
 
 
302 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  24.91 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3501  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.52 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.67568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3583  periplasmic binding protein (iron-binding protein)  23.17 
 
 
265 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  25.48 
 
 
319 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  23.13 
 
 
478 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  22.89 
 
 
306 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.5 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.5 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.5 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.5 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.92 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.17 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  24.43 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  24.63 
 
 
352 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3472  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.52 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.467464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  23.05 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  23.17 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  23.23 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  24.25 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>