23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003423 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003423  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  912    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02355  hypothetical protein  91.98 
 
 
450 aa  851    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1113  hypothetical protein  70.6 
 
 
449 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1725  hypothetical protein  61.78 
 
 
451 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3238  hypothetical protein  37.78 
 
 
465 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0785  hypothetical protein  38 
 
 
466 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3651  hypothetical protein  38.67 
 
 
467 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.270558  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3457  hypothetical protein  38.44 
 
 
475 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0882  hypothetical protein  38.89 
 
 
467 aa  362  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3532  hypothetical protein  38.44 
 
 
467 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0942  hypothetical protein  38 
 
 
466 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3341  hypothetical protein  37.78 
 
 
465 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0835  hypothetical protein  38.44 
 
 
467 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0795  hypothetical protein  37.11 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0885  hypothetical protein  36.22 
 
 
461 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0887  hypothetical protein  36.44 
 
 
461 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0742  hypothetical protein  36.14 
 
 
463 aa  345  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.580335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0762  hypothetical protein  35.11 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0655  hypothetical protein  35.98 
 
 
480 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.166007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2747  hypothetical protein  35.82 
 
 
467 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3388  hypothetical protein  33.63 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2634  hypothetical protein  33.78 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0414  hypothetical protein  33.63 
 
 
451 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0456843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>