23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1113 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003423  hypothetical protein  70.6 
 
 		 450 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02355  hypothetical protein  71.11 
 
 		 450 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1113  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  922    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1725  hypothetical protein  62.19 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0887  hypothetical protein  36.24 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0882  hypothetical protein  36.63 
 
 		 467 aa  326  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0785  hypothetical protein  36.18 
 
 		 466 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3238  hypothetical protein  35.96 
 
 		 465 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3651  hypothetical protein  36.85 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3341  hypothetical protein  35.96 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0942  hypothetical protein  36.18 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3457  hypothetical protein  36.63 
 
 		 475 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3532  hypothetical protein  36.63 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0835  hypothetical protein  36.63 
 
 		 467 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0795  hypothetical protein  35.28 
 
 		 477 aa  319  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0885  hypothetical protein  35.49 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0742  hypothetical protein  35.51 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.580335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0762  hypothetical protein  33.26 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0414  hypothetical protein  36.77 
 
 		 451 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0456843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2634  hypothetical protein  34.67 
 
 		 457 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3388  hypothetical protein  33.91 
 
 		 486 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2747  hypothetical protein  34.2 
 
 		 467 aa  289  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0655  hypothetical protein  33.41 
 
 		 480 aa  289  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.166007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>