23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0887 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0942  hypothetical protein  75.27 
 
 
466 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3457  hypothetical protein  73.75 
 
 
475 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0887  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  953    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3651  hypothetical protein  73.75 
 
 
467 aa  719    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.270558  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0795  hypothetical protein  75.7 
 
 
477 aa  743    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0885  hypothetical protein  85.25 
 
 
461 aa  827    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3532  hypothetical protein  73.97 
 
 
467 aa  720    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0882  hypothetical protein  73.09 
 
 
467 aa  708    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0762  hypothetical protein  78.34 
 
 
473 aa  767    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0835  hypothetical protein  73.75 
 
 
467 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3341  hypothetical protein  75.27 
 
 
465 aa  725    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0655  hypothetical protein  69.87 
 
 
480 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.166007  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3238  hypothetical protein  75.05 
 
 
465 aa  722    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0785  hypothetical protein  75.05 
 
 
466 aa  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0742  hypothetical protein  73.97 
 
 
463 aa  726    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.580335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2747  hypothetical protein  64.35 
 
 
467 aa  627  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3388  hypothetical protein  46.6 
 
 
486 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0414  hypothetical protein  45.76 
 
 
451 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0456843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2634  hypothetical protein  44.87 
 
 
457 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02355  hypothetical protein  37.11 
 
 
450 aa  349  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003423  hypothetical protein  36.44 
 
 
450 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1725  hypothetical protein  37.81 
 
 
451 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1113  hypothetical protein  36.24 
 
 
449 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>