23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0882 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0942  hypothetical protein  92.08 
 
 
466 aa  893    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3457  hypothetical protein  93.15 
 
 
475 aa  904    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0887  hypothetical protein  73.09 
 
 
461 aa  708    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3651  hypothetical protein  93.58 
 
 
467 aa  907    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.270558  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0795  hypothetical protein  75.71 
 
 
477 aa  732    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0885  hypothetical protein  73.52 
 
 
461 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3532  hypothetical protein  93.36 
 
 
467 aa  905    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0882  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  968    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0762  hypothetical protein  71.73 
 
 
473 aa  724    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0835  hypothetical protein  93.58 
 
 
467 aa  908    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2747  hypothetical protein  66.45 
 
 
467 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3341  hypothetical protein  90.99 
 
 
465 aa  887    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0655  hypothetical protein  74.09 
 
 
480 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.166007  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3238  hypothetical protein  91.63 
 
 
465 aa  895    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0785  hypothetical protein  92.36 
 
 
466 aa  889    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0742  hypothetical protein  73.14 
 
 
463 aa  722    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.580335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3388  hypothetical protein  46.62 
 
 
486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2634  hypothetical protein  43.53 
 
 
457 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0414  hypothetical protein  44.77 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0456843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003423  hypothetical protein  38.89 
 
 
450 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02355  hypothetical protein  38.67 
 
 
450 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1725  hypothetical protein  38.26 
 
 
451 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1113  hypothetical protein  36.63 
 
 
449 aa  326  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>