23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0414 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  924    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0456843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2634  hypothetical protein  70.95 
 
 		 457 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0742  hypothetical protein  48.22 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.580335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0762  hypothetical protein  45.43 
 
 		 473 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0887  hypothetical protein  45.76 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0795  hypothetical protein  45.88 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0885  hypothetical protein  46.43 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3388  hypothetical protein  43.76 
 
 		 486 aa  408  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2747  hypothetical protein  45.15 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0785  hypothetical protein  45.21 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3341  hypothetical protein  45.21 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0942  hypothetical protein  44.77 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3651  hypothetical protein  44.99 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3532  hypothetical protein  44.99 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0882  hypothetical protein  44.77 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0835  hypothetical protein  44.99 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3238  hypothetical protein  44.77 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0655  hypothetical protein  45.78 
 
 		 480 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.166007  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3457  hypothetical protein  44.77 
 
 		 475 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1725  hypothetical protein  34.89 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02355  hypothetical protein  33.78 
 
 		 450 aa  302  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1113  hypothetical protein  36.77 
 
 		 449 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003423  hypothetical protein  33.63 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>