23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0942 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0942  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  964    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3457  hypothetical protein  92.69 
 
 		 475 aa  893    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0887  hypothetical protein  75.27 
 
 		 461 aa  726    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3651  hypothetical protein  92.51 
 
 		 467 aa  894    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0795  hypothetical protein  75.99 
 
 		 477 aa  734    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0885  hypothetical protein  75.66 
 
 		 461 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3532  hypothetical protein  92.51 
 
 		 467 aa  894    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0882  hypothetical protein  92.08 
 
 		 467 aa  893    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0762  hypothetical protein  73.41 
 
 		 473 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0835  hypothetical protein  92.29 
 
 		 467 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2747  hypothetical protein  65.58 
 
 		 467 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3341  hypothetical protein  96.77 
 
 		 465 aa  938    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0655  hypothetical protein  74.78 
 
 		 480 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.166007  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3238  hypothetical protein  96.77 
 
 		 465 aa  938    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0785  hypothetical protein  96.78 
 
 		 466 aa  937    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0742  hypothetical protein  72.47 
 
 		 463 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.580335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3388  hypothetical protein  46.41 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2634  hypothetical protein  43.3 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0414  hypothetical protein  44.77 
 
 		 451 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0456843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003423  hypothetical protein  38 
 
 		 450 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02355  hypothetical protein  37.33 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1725  hypothetical protein  37.53 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1113  hypothetical protein  36.18 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>